С севера склоны горы Митридат в Керчи занимало кладбище с могилами известных и почитаемых горожан. Здесь не могла быть не воздвигнута церковь, и в 1864 году такое культовое сооружение было построено по инициативе Маринаки, в честь Святителя Афанасия.
Уникальная архитектура храма восхищает горожан и туристов. Его византийско-греческие мотивы поражают совершенством и гармоничностью.
В 20-е годы прошлого столетия церковь закрыли в связи со сносом кладбища. Во время войны здание сильно пострадало от снарядов, но оставалась действующей. В 90-е это был религиозный центр керченского казачества, здесь они принимали присягу. В нашем веке храм обрел новый купол. Несмотря на небольшие видимые размеры, помещение может вместить до 350-ти человек. Подлинным украшением являются иконы, отданные в дар прихожанами. Особое внимание привлекают образ Спаса Нерукотворного и икона Богоматери с младенцем.