Музей образован в конце 70-х годов прошлого века по инициативе врачей-энтузиастов городских больниц. Является уникальным просветительским и научно-исследовательским центром. Его коллекция насчитывает более трех тысяч предметов, среди которых есть и очень редкие экземпляры, например, книги по медицине, изданные более 250 лет назад.
Кроме печатных экспонатов – книг, научных трудов, рукописей, фотографий – имеется собрание ценных медицинских инструментов, подлинных наград и медикаментов. Экспозиции рассказывают о развитии медицины, начиная с XVIII века до современности, показывают героизм медиков в годы Великой Отечественной войны, а так же служат центром воспитания и просвещения, как для врачей, так и для простых посетителей. На базе музея ведется серьезная научно-исследовательская деятельность.
Музей размещается в старинном особняке постройки XIX столетия, а само здание расположено на территории Второй городской больницы имени архиепископа Луки. Жизни и деятельности этого выдающегося врача и хирурга посвящен отдельный зал.
В фондах есть живопись и графика, работы известных врачей, а настоящей гордостью сотрудников стала коллекция знаменитого ученого Александра Чижевского, изобретателя «аэроионификатора». Здесь хранятся его личные вещи, фотографии и документы.